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代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物（MW〈1000），主要是尿液、血浆或血清、唾液以及细胞和组织的提取液。

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可标准化收集/处理/存储大分子/细胞/组织及器官等生物样本，这些样本的临床、病理、治疗、随访及质量信息也会相应记录，方便快捷对其进行出入库/存储标记/扫描定位并支持与HIS/LIMS等外围互联。

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