肽组学（Peptidomics）分析是一种系统性地研究生物体系中肽分子的技术，常用于研究信号肽、激素肽、降解产物等生物活性肽。肽组学分析流程是一个从样本 → 肽识别 → 差异分析 → 功能解读的系统路径，其核心意义在于发现并理解体内具有功能性的肽分子及其生物学角色。系统性地识别、定量和解释生物体中内源性肽分子，以揭示其生物功能、生理调控机制及疾病相关性,是精准医学和系统生物学研究的重要工具。

一、肽组学分析的意义

1、生物活性肽的系统鉴定

（1）肽组学分析可识别内源性短肽（如激素、信号肽、抗菌肽等），这些肽具有重要的生物活性，往往不通过基因表达直接体现。

（2）有助于发现新的调节分子，揭示组织间信号交流或细胞内调控机制。

2、病理机制的探索

（1）通过比较健康组与疾病组样本中的肽谱差异，可识别与疾病发生、发展相关的肽段。

（2）应用于癌症、神经退行性疾病、代谢性疾病等研究，有助于挖掘疾病标志物和靶点。

3、生物标志物的发现

（1）肽分子稳定性较好，存在于多种体液中（血液、尿液、唾液等），适合作为非侵入性检测的候选生物标志物。

（2）通过定量肽组学，识别疾病特异性差异表达肽，有助于早期诊断和疗效监测。

4、衍生蛋白降解机制的研究

（1）许多肽是蛋白质降解的中间产物，肽谱变化反映了蛋白水解酶的活性状态。

（2）可用于研究蛋白代谢通路、蛋白酶调控网络等。

5、对蛋白质组学的补充

（1）肽组学更注重短肽层级的信息，能揭示传统蛋白质组学中未能关注的小分子调控成分。

（2）特别适用于研究非翻译蛋白产物、剪切产物、降解碎片等。

6、跨学科应用拓展

（1）与代谢组学、转录组学、蛋白组学联合使用，能更全面地构建生物网络图谱。

（2）可在药物开发、营养学、毒理学、精准医疗等领域提供支持。

二、样本采集与前处理

1、目标：获取高质量、代表性样本，排除干扰物

2、常用样本类型：组织（如癌组织）、细胞、血浆、细胞培养上清等

3、注意事项：

（1）采样时间、温度精确控制，防止肽降解或降酶活性遗传

（2）使用EDTA/蛋白酶抑制剂，快速离心、冷冻保存

三、蛋白/肽提取与纯化

1、目标：将复杂样本中的肽与蛋白高效提取并去除干扰成分

2、通用方法：使用含SDS、尿素、盐离子溶液进行裂解；随后采用滤膜、凝胶或固相萃取手段（SPE、C18）除盐、脱脂

3、解决挑战：去除色素（如血清蛋白）、去除脂类，保证质谱信号清晰

四、酶切与肽段生成

1、目标：将大分子蛋白切割成适合质谱检测的肽段

2、常用酶：胰蛋白酶（Trypsin）—特别适合生成带赖氨酸或精氨酸结尾的肽段

3、条件优化：pH ≈ 8.0、37 °C、12–16 h；防止非特异性切割

4、技术点提示：双酶策略（联合胰蛋白酶+Lys-C）可提高覆盖度与重复性

五、肽段分离与液相色谱系统（LC）

1、目标：分离复杂肽混合物，提升后续质谱检测信噪比

2、主流手段：反相液相色谱（RP-LC），常用C18柱；梯度洗脱方案，流速与梯度时间精细调控

3、可扩展技术：多维色谱（如强阳离子交换HX-LC+RP-LC）适用于非常复杂样本

六、肽组学分析之质谱检测（Mass Spectrometry）

1、目标：对分离后的肽段进行高分辨/高精度检测

2、主流仪器类型：

（1）Orbitrap：高分辨率、高质量准确度，适合复杂样本高通量分析

（2）Q-TOF：快速扫描速度，适合定性分析

（3）Ion Trap + 动态排除：增强灵敏度

3、检测方式：

（1）DDA（Data-Dependent Acquisition）：选择强信号肽段实时碰撞（CID/HCD）破碎

（2）DIA（Data-Independent Acquisition）：同时收集全谱段信号，适合定量分析

4、行业趋势：越来越多研究趋向使用 DIA 和图谱库结合的定量策略，以提高复现性与覆盖率。

七、数据处理与定量分析

1、目标：从质谱Raw数据中识别肽序列，进行相对/绝对定量

2、工具汇总：

（1）Byonic/MaxQuant（DDA）：肽段匹配、QC、FDR过滤

（2）Spectronaut/ScaffoldDIA（DIA）：图谱匹配、定量分析

（3）Perseus/RStudio：差异分析、可视化

3、关键参数：

（1）FDR ≤ 1 %，肽段长度 7–30 aa

（2）信号归一化方法（iBAQ、LFQ、TMT、SILAC 等）

八、生物信息学解读

1、目标：将差异表达肽转换为生物学意义清晰的机制解释

2、常用注释系统：

（1）GO、KEGG、Reactome

（2）激活通路、蛋白-蛋白互作（PPI）、上游转录调控分析

（3）可视化工具：Cytoscape、R/Shiny等

九、肽组学分析流程图示意

1、样本准备

2、蛋白质提取

3、蛋白质预处理（去除高丰度蛋白、还原/烷基化等）

4、蛋白酶解（可选，若分析内源肽则跳过）

5、肽段富集（固相萃取、过滤、分子量切割等）

6、液相色谱（LC）分离

7、质谱分析（MS/MS）

8、原始数据获取

9、数据库搜索（匹配肽段，鉴定肽序列）

10、定量分析（标签法/无标签法）

11、生物信息学分析（GO/KEGG通路、聚类、网络分析等）

12、数据解读与生物学意义挖掘

百泰派克生物科技提供从采样工具到专用冷冻管的一体化肽组学分析解决方案，确保采样过程标准化、可追溯。我们的多功能SPE柱产品结合高保留率、低损耗特性，极大提升肽段提取效率。全流程服务覆盖采样、SPE提取、质谱整合、图谱分析、验证实验，具备行业领先的仪器+试剂+服务组合优势。通过 DIA 结合图谱库、高通量 PRM 和在线可视化，帮助科研人员提升效率、提升论文及项目说服力。如您有肽组学研究需求，欢迎联系百泰派克生物科技，让我们携手，以最前沿的肽组学技术，共同揭示生命奥秘！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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